システムフォントを誤って削除してしまった場合、再インストールはできるのでしょうか？

バックアップがあれば戻せばよいですが、フォントだけ再インストールというのは出来ません。

バックアップがなければ、外付けhddに現在の状態のバックアップを作って（ディスクユーティリティの復元かTimeMachineを利用）、一旦、ディスクをフォーマットした上で、クリーン再インストール（ここでシステムフォントは戻る）、移行アシスタントでバックアップを戻す（システムのファイルはそのままで、アプリ、設定、データなどが戻る）、という手順になります。

OS X 10.6 を上書き再インストール（ユーザー設定、アプリケーション、ユーザーデーターはそのまま残ります）すればよろしいかと思います。

OS X 10.6 インストール DVD をセットして＜ C ＞キーで起動し、下記参考サイトの＜パート２：オペレーティグシステムを再インストールする＞のみを行ないます。

参考サイト：Mac OS X v10.6 Snow Leopard：消去してからインストールする ...

追伸＞はに さんのやり方の方が手順が少なくて早いです。

失礼致します。

まだ「ゴミ箱」を空にしていない場合限定ですが、「ゴミ箱」を開き、削除したフォントデータを選択して、

右クリックでコンテキストメニューを表示させ、「戻す」で元の場所へ戻して見ては如何でしょうか。