セーフモードで立ち上げてもアイコンがぐるぐるまわってるだけで変化がありません。

なんか、やばそうですが、普通に起動出来るなら、バックアップ最優先。

その後、

１　シングルユーザモードで起動して、fsck -fyを実行するか、

２　復元システムから起動し、ディスクユーティリティでディスク修復を実行する

の何れかでしょうかね。

参考

トラブルシューティング for Mac (ソフトウェア編)

どの対処法が良いかは私も悩みどころですが、

書かれた内容から勝手に諸々想像して対処するなら私はターゲットディスクモードで起動して他のMac 等でユーザーデータだけでも救出できるか試します。