電源ボタン以外のキーボードが反応しない

■環境

MacBook Pro (Retina, 13-inch, Late 2013)

OS:macOS Sierra 10.12.4

プロセッサ：2.4 GHz Intel Core i5

メモリ：8 GB 1600 MHz DDR3

起動ディスク：Macintosh HD

グラフィックス：Intel Iris 1536 MB

■症状

電源ボタン以外のキーボードのキーが反応しなくなりました。

ログイン時のパスコード入力時と、セーフモードでの起動時は通常通り反応します。

ユーザーログイン後電源以外の一切のキーが反応しなくなります。

トラックパッドは問題なく使用できます。

USB外付けキーボードを繋いで対処している状況です。

■直前の動作・考えられる原因

・HDMIで外部モニタをつなぎ12時間ほどスリープ状態にしたあとHDMIを抜きノートを開いた際、画面も移らずキーもパッドも反応しない状態が5分間ほど続いたため電源キーを長押しして強制再起動を行いました。

その直後からの発症です。

■対応済対策

・再起動

・セーフモードでの再起動

・PRAMリセット

・SMCリセット

・アクセス権の修復（途中で12時間以上止まってしまい未完了？）

・新規ユーザー作成

上記ネットで調べて引っかかることは大体試しましたが改善しませんでした。

端末起動直後やセーフモードで正常に反応することからハードではなくソフト側の問題だと予想していますが、

同じような症状が出ている方また改善された方がいらっしゃいましたらアドバイスをいただきたいです。

諸事情でストアへの持ち込み修理が難しいためできる限り自家で対処（最悪はOSのクリーンインストールを）できればと思っております。

何卒よろしくお願いいたします。