失礼致します。
ファイルを削除しても容量が変わらないと言うのは、「OS X El Capitan(10.11.x)以前の「この Mac について」>「ストレージ」で良く見られた、誤表示かも知れませんね。
下記の要領で「Spotlight」のインデックスを再作成して見て下さい。
Mac で Spotlight のインデックスを再作成する方法 - Apple サポート
1.他に何もアプリケーションを起動させていない状態で、「システム環境設定」>「Spotlight」>「プライバシー」タブを選択し、ウインドウ左下に有る「+」ボタンをクリック。
2.表示されるプルダウンパネルの「Spotlight の検索から除外する場所を選択」ボタンをクリックして「Macintosh HD」を選択し、プルダウンパネル右下の「選択」ボタンをクリック。
3.下の画像の様なダイアログが表示されますので、「OK」ボタンをクリック。
4.「Spotlight の検索から除外する場所」に追加したMacintosh HD」をクリックして選択し、ウインドウ左下に有る「ー」ボタンをクリックすると、「Spotlight」のインデックスの再作成が開始されます。
5.iMac を「セーフモード」で起動後に、再起動してからログイン。
(kiitos326 さんは既に「セーフモード」で起動されていますが、このタイミングでもう一度行なって下さい)
6.「Spotlight」のインデックスの再作成は、かなり時間が掛かりますので、最低でも 30 分以上経ってから確認して見て下さい。