かな入力で「ぢ」「づ」を含む変換時に「じ」「ず」が勝手に挿入され正常な変換が行えない

失礼致します。

私の環境は、macOS High Sierra（10.13.4）の MacBook Pro（Retina, 15-inch, Mid 2012）です。

普段は「ローマ字入力」で使用していますが、user_one さんの質問を見て検証して見た所、「かな入力」で「ライブ変換」が「オフ」の場合は、下の画像の様に同様の症状が発生します。

「システム環境設定」＞「キーボード」＞「入力ソース」タブで、「日本語 IME」の「ライブ変換」を「オン」にすると、

或る程度は問題無く変換出来る様になりますが、

「スペース」キーで変換を続けて行くと表示される、アルファベットを含む変換候補を１度でも選択してしまうと、やはり同様の不具合が発生しますので、要注意（アルファベットを含む変換候補が表示されたら選択しない様に、「スペース」キーではなく、マウスやトラックパッドで直接別の候補を選択）です。

以下のトラブルシューティングを行なっても改善しませんでしたので、「日本語 IME」自体の不具合の可能性が高いと思います。

• 「変換学習」をリセット
• 「セーフモード」で起動した状態でログイン
• 新規作成したユーザアカウントにログイン
• 「NVRAM リセット」
• 「SMC リセット」
• macOS を再インストール

「日本語 IME」自体の不具合の場合、下記リンクのページからフィードバックして、Apple が修正してくれるのを待つしかないと思います。

macOS - フィードバック - Apple（日本）

修正されるまでの応急処置として「ライブ変換」を「オン」にして使用するか、或いは「ATOK」、「かわせみ２」、「Goole 日本語入力」等の他社製の日本語入力を使用するかと言う事になるかと思います。