ログインするApple IDがいっしょだと、LINEは別々にできませんか?

「この回答で解決」とのマークが既に付いておりますが、コメントさせて頂きます。

同じ Apple ID で利用する複数の Apple デバイスにおいて、LINE のアカウントを別々のものにすることは可能です。

その際、個々のデバイスに電話機能は必須ではありません。LINE のアカウント登録には電話番号が必須ですけれど、固定電話の番号でも登録ができるからです。

実際に私は電話機能の無い iPad において、iPhone とは異なる LINE アカウントを、登録して利用しています。

Apple IDは個人を特定する識別情報なので、別にすべきです。

参考

https://support.apple.com/ja-jp/HT201084

LINEの利用に電話番号が必須かどうかはLINE次第。