購入後に支払い方法を変更したら、購入済みのものも支払い方法変更できますか？

失礼致します。

残念ながら、購入した時点で既に支払い済みですので、購入後に Apple ID の「お支払い方法」を変更しても、既に購入済みのコンテンツの「お支払い方法」には反映されません。

（反映されるのは、Apple ID の「お支払い方法」を変更後に購入した物だけです）

Apple ID のお支払い方法を変更・追加・削除する - Apple サポート (日本)

必ず返金される訳では有りませんが、もし可能であれば、下記リンクの手順で、誤ってキャリア決済で購入してしまったコンテンツの返金手続きを行い、Apple ID のデフォルトの「お支払い方法」をクレジットカードに変更後に再購入 されて見ては如何でしょうか？

（返金される場合は、購入時に使用した「お支払い方法」に返金されます。 キャリア決済の場合は、最長 60 日掛かる場合が有ります）

• Apple から購入した App やコンテンツの返金手続きをする - Apple サポート (日本)
• Apple から購入した App やコンテンツの返金手続きの進捗を調べる - Apple サポート (日本)

necotaさんの書かれた通り、決済済みのものは変更できません。

また、キャリア決済で限度額オーバーして保留になっている場合も、キャリアで対処が必要で、後から追加した支払い方法は適用されません。