iTunes for WindowsとiPhone上の曲数が異なる

どうもよくわからない文章なのですが…

何度同期してもitunesで購入した曲以外、表示されません。

以前、CDから取り込みをした曲が表示されていないようです。

これはどちらのデバイスの話ですか（パソコン？iPhone？）

iPhoneの話（パソコンの曲がiPhoneに入らない）だと思って読んでいたのですが、

PC上の情報を元にするのがデフォルトのようですが、

iPhone上の曲をPCに同期する方法はありませんか？

ということは、iPhoneの曲がPCに入らないということですか？

「iPhone上の曲をPCに同期する方法」はありません。

というより、同期した時点でiPhoneのコンテンツはiTunesと同じになるはずですが（iTunesにない曲はiPhoneからも消える）、そうならないというのは、「手動で同期する」設定にしていらっしゃるのでしょうか。

以前にCDから取り込んだ曲は、もともとそのCDを取り込んだパソコンのデータ（もしくはそのバックアップ）を現在のパソコンにコピーしてください。それができない場合は、CDから再度取り込んでください。

念のため少し補足しておきます。

CDから取り込んだ曲の同期はパソコン→デバイス（iPhoneなど）への一方通行です（逆は不可）。

iPhoneに直接CDの曲を取り込むことは、通常はできないので、最初にパソコンに取り込んでそれをiPhoneに入れて（同期して）聴いていらっしゃると思います。なので、パソコンを買い替える場合は、古いパソコンから新しいパソコンに音楽データを移行する（コピー）という形で、新しい方に音楽を入れることになります。

最近は、iPhoneなどのデバイスに直接CDから音楽を入れる機器があるそうですが、そうやってiPhoneに入れた音楽をパソコンにコピーすることはできないと思います。