統計解析ソフトRでRコマンダーを使用するためにXQuartzをインストールしたのですが、XQuartzが起動するとRが落ちてしまいます。。

あとはXquartzのフォント周りのバグの可能性があるのでXquartzのバージョンを2.8.0にしてみてください。

アプリをゴミ箱に入れるだけではバージョン変更できないので，

https://www.xquartz.org/releases/index.html

にのっている手順に従ってダウングレードしてください。

ところでXquartzを起動してからRを起動するときはxtermを使用していますか？

山勘ですが、rosetta2をインストールしてみたらどうですか？

rosetta2はターミナルで

softwareupdate --install-rosetta

とすればインストールできます。

softwareupdateの後には半角スペースがあります。

softwareupdateの使い方は、man softwareupdateとするか、単にsoftwareupdate[enter]とすれば出てきます。

macbook air m1、ventura 13.3.1(a)で試してみました。

Rは4.3.0-arm64.pkg、Xquartz-2.8.5をインストールしました。

どのパッケージをどのようにインストールされたのかわかりませんが、これにRStudio-2023.03.0-386.dmgをインストールして実行したら、うまくRは動いてるっぽいですけど。RStudioをインストールして実行すると、さらにコマンドツールか何かダウンロード・インストールされました。

ただ、小生、Rは使い込んだことありませんので、これでいいのかどうかよくわかりませんけど。

私が使ったR packageは

R-4.3.0-arm64.pkg

です（R 4.3.0 "Already Tomorrow" released on 2023/04/21）。Rのサイトに置いてあるmacOS用のバイナリーパッケージです。

R 4.3.0 binary for macOS 11 (Big Sur) and higher, signed and notarized packages.

とあります。

これは使われたものと同じですか？

もし、違うなら、こちらを使われてみてはいかがでしょうか？

どうにもならないなら、venturaをクリーン再インストールしてからRをインストールしてみるしかないかも。

内蔵システムでやるのは大変でしょうから、取り敢えずは、外付けssdにventuraをクリーン再インストールしたシステムを用意してそれでにRをインストールしてみるのが良いかも。Appleシリコン機のventuraだと、外付けssdもusb 3.1 gen2（10Gbpsの接続）以上のものでやらないと信頼できるシステムにはなりません。usb 3接続（5Gbpsの接続）のssdではうまくインストールできない、確実には起動しないおそれが多分にあります。thunderbolt 4/usb4接続（40Gbpsの接続）のssdなら問題ありません。

後、ちょっと思うのはアンチウィルスソフトの影響は考えられませんか？

XquartzはX11接続が使えるターミナルです。RcmdrはX11接続でRのGUI表示を作ります。何らかの原因で、X11接続が阻害されてるとか。可能性として一番高いのはアンチウィルスソフトです。もし、何かアンチウィルスソフト使ってるなら、取り敢えずオフにしてみる。簡単には、セーフモードで起動して、Rcmdrが使えないかチェックしてみるかな。

でもアンチウィルスソフトの影響はオフやセーフモードにしたぐらいでは消えないことも多いようですから、アンインストールしないとわからないかもしれません（アンインストールして再起動）。

まず，アプリケーションー＞ユーティリティにあるXQuartzをダブルクリックして起動してください。

XQuartzが起動している状態でRを開いてlibrary(Rcmdr)とすれば足りないパッケージをインストールする誘導がでるはずです。

Rcmdrも試してみました。

普通に起動しますね。

Rを実行して、そのまま

install.packages("Rcmdr")

としただけです。なので、Rcmdrがうまく立ち上がらないとしたら、Rのバージョンとかに問題ありませんか？

あるいは、install.packages("Rcmdr")でパッケージが足りないまま終了してしまったとか。

一応、念のために書いておきます。

R-4.3.0の指定はXquartz 2.8.5です。

私が試したところでは、特にxtermから起動しなくても、ファインダーでRを実行するだけでRcmdrは立ち上がります。