numbersのファイルが開けなくなってしまった場合は？

Timemachineをお使いであれば過去の（大丈夫だと思われる）日付のファイルを復元してみたらどうでしょう。

そうすると，開ける時点のバックアップがないと無理かと思われます…。

＞〜を開けません。ファイルを読み取れませんでした。

というメッセージが，ファイルの破損を意味しているのか，他の要因なのか，私には判断つきかねるのですが，

「更新を重ねる」ファイルであるなら，ファイル名の後に日付をつけて保存するのも策としてありかと（ファイル数がどんどん増えますが）思ったりします（私はモノによってはそうしてます）。