iTunes を通じて曲を購入したが iPhone にダウンロードされない

失礼致します。

奇妙に思いiTunesで購入履歴を調べたところ件の曲が存在しませんでした。

「購入履歴」の確認は、下記リンクの手順 で行われていますでしょうか？

App Store やほかの Apple メディアサービスの購入履歴を確認する - Apple サポート (日本)

カード決済は終わっているようですのでその点に関しては問題かと思うのですが。

これは、Apple から当該の曲の「領収書」メールが届いた、或いはカードの明細に当該の曲の請求額が記載されている と言う事でしょうか？

そうでない場合は、念の為、Apple アカウントの「お支払い方法」に、エラー等が発生していないか確認 して下さい。

既に登録済みの Apple アカウントの「お支払い方法」にエラーが発生している場合は、まずその問題を解決しないと支払いを行う事は出来ませんので、エラーが発生しているお支払い元に問い合わせて、以下の様な問題を解決 する必要が有ります。

• カードの有効期限が切れている。
• 引き落とし先になっている口座の残高不足。
• 利用限度額の制限等に引っ掛かっている。

>iPhone にダウンロードされておらず

自動ダウンロードを有効にしているのにダウンロードされていないってことですか。

iPhone側のネットワーク関係の設定も関係してそうだが。

>iTunesで購入履歴を調べたところ件の曲が存在しませんでした。

購入済みに反映するのが遅れている可能性は？