バッテリーがなくなって再起動後、LINE やインスタが 1 時間経っても開かなくなります

毎回って、いつもバッテリーがなくなるまで放置しているということですか？

とりあえず、バッテリーが20%を切る前に充電する習慣をつけてください（残りが50%でも60%でも、時間があるときに充電して大丈夫です）。バッテリー残量がほとんどなくなってから充電することが、最もバッテリーの負担になります。

そうではなくて充電後にいつもそのアプリが開かないのなら、アプリの問題なので、再インストールを試してはいかがでしょうか。