何かをする前に Time Machine などで Mac をバックアップしてください(必須)。
下記リンク先は同様な話題です。が、Safari の話ではありません。
https://applech2.com/archives/20240922-macos-15-sequoia-firewall-issue.html
https://waclaw.blog/macos-firewall-blocking-web-browsing-after-upgrading-to-sequoia/
上記リンク先と同様な場合はシステム設定を終了してからターミナルを開いて
/usr/libexec/ApplicationFirewall/socketfilterfw --add /Applications/Safari.app
をコピー&ペーストしてリターンキーを押してください(Safari 用にコマンドを変更しています)。「外部からの接続を許可」が選択できるようになっている、かもしれません。
上記リンク先と同様ではないか問題が改善しない場合はスクリーンショットを投稿してください。
Mac でスクリーンショットを撮る - Apple サポート (日本)
なおリストから削除するだけなら
/usr/libexec/ApplicationFirewall/socketfilterfw --remove /Applications/Safari.app
で良いのではないかと思います。
あとは素朴にセーフモードとか First Aid とか上書きインストールとかでしょうか。