macOS Sequoia - ファイルをダウンロード後、右上の矢印ボタンを押すと URL バーが反応してしまう

状況を再現できません。　お使いのデバイスやアプリ等の情報を教えて下さい。　可能ならば、スクリーンショットを貼り付けていただけると助かります。　→ Macでスクリーンショットを撮る - Apple サポート (日本)

ツールバーをカスタマイズしていますか？　もしそうならデフォルトに戻してみましょう。

あるいはウインドウ幅が狭すぎると何か起こりそうですが...

フルスクリーン状態だとお書きの状態になりますね。フルスクリーン解除して使うのが

一番簡単な対策でしょうか。