Logic Proにてギターを録音する際に片CHしか聴こえない

一読する限りでは，Logic Proのアンプシュミレータのソフト的な不具合（？）発生かと思われます。

（不具合発生のトラックからアンプシュミレータを外したり，他のプラグインをかけたりしたら正常動作なのですよね）

プラグインマネージャを開くと，

「選択項目をリセットして再スキャン」とか「Audio Unitのフルリセット」とかありますが…どんなことになるか私も試したことはありません。

あと，該当プラグインを右クリックすると「削除」のメニューが現れますが，一旦削除した後，再インストールできるのか，これも試したことはありません（私は怖がりなので，多分同じ境遇だったらさすがに試してみるのは躊躇してしまうと思います）。

Logic Pro自体を再インストールした方が作業としてはリスクはないと考えられます（ただLogic Pro本体ではなく個々のプラグインに関与する不具合なら意味ないかも）。

あるいは，

Mac 用 Logic Pro が機能しない場合 - Apple サポート (日本)

を試してみるか，

＞録音作業に支障が出ており〜

ということなら，あれこれ迷うよりAppleサポートに電話で相談するのが確実なように思います。

私だったら迷わず相談すると思います。

あの，色々検証されているようですが，問題の切り分け方がうまくいってないように思います。

そもそも最初の投稿の

アンプシュミレーターを使用せず、ダイレクトモニタリングの状態ですと、LR共に聞こえます。

普通ダイレクトモニタとはDAW(Logic Pro)を通さず，オーディオI/Oのインプットを直接モニターすることだと思いますが，そのことをおっしゃっていますか？それとアンプシュミレータを使用せずとを比較することは無意味です。

単に「アンプシュミレータを使用した時と，それを外したとき」はどう違いますか？

今までの投稿内容からは，それを検証されているように思えません。

＞オーディオインターフェース側の出力設定を替えても、片方のチャンネルしか鳴らない

これも辻褄が合っているとは言えません。Logicの出力がおかしければオーディオインターフェース側の出力設定をどう変えようが良くなるはずはありません。

＞Logic側でMIDI音源を鳴らすとイヤホン出力は可能である為、Logic側の設定は間違えない状態

これもLogic Proの出力およびモニター系統が正常かどうかの検証の説明になってません。イヤホン出力とはどこの出力ですか？

macの内臓出力ですか？それともオーディオインターフェースのイヤホン（ヘッドホン）出力ですか？

＞上記の状況からPC以外のインターフェース側等に要因がありそう？です。

なので，そうおっしゃる根拠がありません。

もう一度冷静になってトラブルの経路を整理して検証なさるのがいいと思います。