Pagesやnumbersのファイル名が変更できない

いくらでも変更できますけど。

別名で保存なら、optionキーを押しながらファイルメニューを開けると出てきます。

ま、これは昔からですけど。

一般ユーザー向けの掲示板に書いてもAppleには伝わらないので、こちらからバグレポートなどで改善要求をあげてください。

製品フィードバック - Apple（日本）

ちなみに、Finderでできないって事ですか？

ファイルはクラウド上？ローカル？

再起動などは試してますか？

私もSequoiaを使っておりますが、現象を再現できないでっす。　バグではないのではないでしょうか？　iCloud.comでも再現できないです（ファイル名変更可能）。