クレジットカードをバインドしたときにApple IDが無効になった場合はどうなりますか?

Appleアカウントは本当に無効になってますか？

取り敢えずはカード会社にアップルからの請求には応じないようにしてもらうとか。別のAppleアカウントで同じカードを登録してる場合にはそうできませんけど。

アップルに確認して、Appleアカウントを使えるようにできるのならそうしてからカードを削除する方が確実です。無効でどうにもならないならAppleアカウントそのものを削除してもらう方が良いのでは？

Appleアカウントが本当に無効なら、そのアカウントでは登録したカード（含Apple Pay）も使えませんから何も悩むことはないです。でも無効というだけでは心配ですから（誰かがアカウントを使えるようにすればカード・Apple Payも使えてしまいます）削除してもらう方が安心できます。いずれにしろ、Appleアカウントとは無関係にカードそのものは使えます。