iPhoneにおいてのAppleデバイスでのPCとの同期及びバックアップについて

＞例えば、まだPC上に何のバックアップデータが無い状態で同期をすると、データが無しと同期するということとなり、既存のデータも消えてしまう可能性がある、ということでしょうか？

データの種類によっては、パソコン上にデータ（バックアップデータではありません）がない状態で同期するとiPhone上のデータが消えてしまう（パソコンのデータで上書きされてしまう）ことはあり得ます。代表的なのが音楽。音楽だけは、同期はパソコン→iPhoneの一方通行なので、そのときパソコン上にあるデータが最新の状態になります。

>>データが無しと同期するということとなり、既存のデータも消えてしまう可能性

これは無いでしょう、それだと何時まで経っても同期できません。

消えるのは、どちらかで削除した場合。

因みに、当方はバックアップと同期は別モノという解釈です。

バックアップとは、iPhoneのデータをそっくりPCにコピーすることであるというのは理解しております。

これ、間違ってます。

パソコンへのバックアップの場合、暗号化しないとアプリのデータはバックアップされません。

また、どのアプリがインストールされているかの情報はバックアップされますが、アプリそのものはバックアップされませんし、iCloudと同期されているデータ（カレンダーや連絡先、同期している写真など）もバックアップの対象外だったはずです。

この同期の場合の最新の状態というのは、どのデータと比較して最新の状態ということなのでしょうか？

iCloud上が常に最新になる様に同期されると思えば良いです。

例えば、まだPC上に何のバックアップデータが無い状態で同期をすると、

バックアップデータがないってのが意味不明ですが、未同期のPCなら、iCloud上のデータがPC上にコピーされるのが基本です。

データが無しと同期するということとなり、既存のデータも消えてしまう可能性がある、ということでしょうか？

同期後に端末上でデータを消してから再び同期すると、iCloud上のデータも消えます。

同期には片方向と双方向があり、どうなるかはデータ次第だが。