ストレージがいっぱいで初期化するか迷ってます

初期化すると買った時の状態になるだけで、使えなくなることはないです。ただ当然ながら アプリや写真はすっかりなくなります。

ストレージが十分ない時に写真を大量に削除したり共有アルバムに入れると写真がシステムに移ってシステムが肥大化してしまうことがあるようです。共有アルバムに写真を入れて削除してその態になっているなら、一度初期化してバックアップを戻すか、全ての設定のリセットでシステムが圧縮できるか試してみるのもいいかも。

iPhoneの設定をデフォルトにリセットする - Apple サポート (日本)

逆に使えなくなるとか危険性はあるのでしょうか？

一般ユーザとしては，絶対大丈夫とは誰も言えないでしょう。

参考にしてください。

https://discussionsjapan.apple.com/thread/256241023?sortBy=oldest_first

なるほど，システムデータが異様に多くを占めているという似たようなケースが最近散見されます。

実行されるなら，幸運を祈ります。

バックアップだけは確実に，大切なデータだけはなくなったら一生どうしようもありません。

iPhoneはぶっ壊れたとしても修理するなり，最悪買い替えれば済みます（お金はかかりますが）。