iWork（Numbers、Pages、Keynote）のアップデートができません

今のをゴミ箱に捨てて、App Storeからダウンロード・インストールすれば良いのでは？

でも、認定整備品でそんな状態だとちょっと心配です。

システム設定＞一般＞転送またはリセット＞すべてのコンテンツと設定を消去で初期化してmacOSをクリーン再インストールする方が良いかも。そうすれば当然Pagesなどもクリーン再インストールすることになります。

すんなり初期化できれば、特に連絡する必要はないと思います。

ただ、途中で、知らないAppleアカウントが出てきて、パスワードを入力しろなんて言われたら、サポートに連絡してアクティベーションロックを解除してもらう必要があります。

Macを消去して工場出荷時の初期設定にリセットする - Appleサポート

自分も認定整備品のmacbook airを購入したことがあります。自分の時は型が少し古いだけで新品状態でした。