Time Machineのバックアップがすべて最新に上書きされてしまう

＞過去の日付フォルダのバックアップすべてが、現状のデータ（最新）に上書きされていました。

ちょっとありそうもないことですが、これはどのようにして確認されましたか。

膨大な（かどうかわかりませんが）バックアップデータがすべて「同一」（ということですよね？）であると確認するのは、そう簡単ではないと思うのですが。

誤ってファイルを削除した（ゴミ箱も空にした？）のはいつのことでしょうか。

私はかつて、数か月さかのぼってファイルを復元した経験がありますが、単に消す前の時点までさかのぼれていないだけという可能性は…？

私はデータを保存するための外付ストレージを利用していないので、「Time Machineバックアップをブラウズ」で外付ストレージがどのように見えるのか確認できないのですが、もちろん、外付HDD（あるいはその中の、削除したファイルが保存されていたフォルダ）をFinderに開いた状態で、「Time Machineバックアップをブラウズ」していらっしゃいますよね。

念のためですけど、メニューバーのTime Machineアイコンから「Time Machine設定を開く」（または「システム設定＞一般＞Time Machine」）の「オプション」で、「バックアップ対象から除外」に、そのHDDが登録されていないか確認してみてはいかがでしょうか。

それから、余計なおせっかいかもしれませんが、データを削除してすぐにゴミ箱を空にするのは、やめた方がいいと思います。

REDESIGN様

>> 仕事で使用している「外付けのHD」のみでした。

外付けHDを起動ディスクとして

切り替えて運用されているのでしょうか？

>Time Machineを見たところ、過去の日付フォルダのバックアップすべてが、現状のデータ（最新）に上書きされていました。

過去の日付フォルダにどういう操作でアクセスしてますか。

例えば、Timemachineに入って過去にさかのぼってるんですか。

>仕事のファイルのみの保存用です。

Time Machineのバックアップ先と兼用してたんですか。

Time Machineによる外付けドライブのバックアップを途中で止め、止めた当時の内容が表示されたのかなとも推測。

外付HDDと内蔵ストレージのバックアップを、どちらも同じ別の外付ストレージに取っていたということですか。

同じHDDに仕事用のファイルとバックアップが同居しているということではありませんよね。

つまり、その外付けのHDのバックアップ設定が間違って、

現状のデータに上書きされてしまっている？ということなのでしょうか。。。

どういう設定をしているのかお書きにならないと，間違っているのかどうか誰にもわかりません。

誤ってファイルを削除しゴミ箱を空にしたのは、今日の話です。

どういう操作手順でファイルを削除したのかお書きください。

ひょっとしたら，それが原因かもしれません。

REDESIGN様

>> 外付けHDは起動ディスクではなく、仕事のファイルのみの保存用です。

>> 起動ディスクは通常通り本体です。

「仕事のファイルのみの保存用」を

クラウドと同期させたりしていませんか？

普通にエイリアスがエイリアスとしてバックアップされるので中身はありませんよ。

ひらけば当然外付けHDDを見ることになるので最新でしょう。

エイリアスの日付はエイリアスを作った日付だと思います。