ディスクユーティリティで復元したものは起動ディスクにできない？

ディスクユーティリティでMacのHDDにあるデータをシステムごと外付けHDDに復元させたのですが、復元できた後、システム環境設定の起動ディスクで復元したものを選択し再起動させたのですが、起動の音が鳴りリンゴのマークが出た所まではよいのですが、リンゴマークの下に出るくるくる回るやつがいくら待っても出てこない状態です。ディスクユーティリティで復元したものは起動ディスクにできないのでしょうか？
外付けHDDは160GBで60、60、40にパーティションで区切ってその一つの60GBに「復元先を消去」させ復元しました。消去する前はCarbon Copy Clonerでコピーしたものを普通に起動できていました。
OSは10.3.5です。よろしくお願いします。