使用していない間にApple Pencilのバッテリーが0%になっている

失礼致します。

しかし、次にApple Pencilを使おうとしたときには元々残っていたバッテリーも無くなり0%になっています。

誤表示の可能性を排除する為に、念の為、当該の Apple Pencil（第 2 世代）で操作して、反応しない事を確認 して下さい。

側面につけ直してみると充電自体は問題なく行えます。

これは、一旦 Apple Pencil（第 2 世代）を取り外して、再び iPad Air（第 5 世代）の長い側面の磁気コネクタに付け直すと、100 % まで充電出来る と言う事でしょうか？

なにか改善する方法はないでしょうか。

念の為、下記リンクの手順で iPad Air（第 5 世代）を初期化して見ても、同様の不具合が発生するか確認 して見て下さい。

iPhone、iPad、iPod を初期化する (工場出荷時の設定に戻す) - Apple サポート (日本)

また、Apple PencilとiPadAirどちらに問題があるのでしょうか。

iPad Air（第 5 世代）を初期化しても改善されない場合は、バッテリー残量が「0」の状態が続き過放電が発生すると、バッテリーに回復不能の障害が発生しますので、Apple Pencil（第 2 世代）のバッテリーの蓄電容量自体が極めて低下 している可能性が有ります。

只、いつも Apple Pencil（第 2 世代）を使用した後は、iPad Air（第 5 世代）の長い側面の磁気コネクタに取り付けて充電されているとの事ですので、そもそも Apple Pencil（第 2 世代）のバッテリー残量が「0」になる様な元々の原因が、どちらに有るのか不明 です。

もし、ご家族やご友人が以下の何れかのモデルと Apple Pencil（第 2 世代）をお使いの場合は、以下の手順でどちらに問題が有るのか確認 して見て下さい。

• 12.9 インチ iPad Pro（第 3 〜 6 世代）
• 11 インチ iPad Pro（第 1 〜 4 世代）
• iPad Air（第 4・5 世代）
• iPad mini（第 6 世代）

【 確認方法 】（ご家族やご友人の iPad モデルと Apple Pencil（第 2 世代）で、問題無く充電出来ている事が前提です）

• ご家族やご友人の Apple Pencil（第 2 世代）を、かるぱっちょp さんの iPad Air（第 5 世代）に取り付けて、問題無く充電出来るか確認。

　　（充電出来ない場合は、かるぱっちょp さんの iPad Air（第 5 世代）に問題有り）

• ご家族やご友人の iPad モデルに、かるぱっちょp さんの Apple Pencil（第 2 世代）を取り付けて、問題無く充電出来るか確認。

　　（充電出来ない場合は、かるぱっちょp さんの Apple Pencil（第 2 世代）に問題有り）

• 上記のどちらも充電出来ない場合は、かるぱっちょp さんの iPad Air（第 5 世代）と Apple Pencil（第 2 世代）の両方に問題有り。

もし、ご家族やご友人が、上記の iPad モデルと Apple Pencil（第 2 世代）をお使いでない場合は、お近くの Apple 正規サービスプロバイダや Apple Store 直営店に、「持ち込み修理」を予約をした上で iPad Air（第 5 世代）と Apple Pencil（第 2 世代）の両方を持ち込んで、診断 して貰って下さい。

iPad の修理サービス - Apple サポート (日本)

間違いなく、Apple Pencilの寿命でしょう。

タイミングよくApple Pencil Proが発売されたので

良い機会として、買い替えると良いでしょう。

Apple Pencil ProはApple Storeアプリによると対応機種は2024年発売のiPad AirとiPad Proだけの様です。