iPhone SE (第3世代) - カナダで購入した端末に日本のアカウントで設定し、日本のアプリを管理したい

日本のキャリアーのsimもお持ちということなら、日本に滞在してる時に、国・地域を日本にしてAppleアカウントを作成すれば良いのでは？

日本の銀行管理もしたいということなら、カードも日本国内の金融機関が発行したカードもあるのでは？それを支払い方法に登録すれば良いです。Appleアカウント作るだけなら、支払い方法なしでも作れます。

新しいApple Accountの作成方法 - Apple サポート (日本)

以前の書き込みでは、日本で海外の国・地域のアップルアカウントを作ることもできたようですが、最近はその国に滞在してないと作れないのかもしれません。

購入されたiPhoneをAppleアカウントなしでセットアップ（Appleアカウントのセットアップの時に後でとかスキップにすればAppleアカウントなしでセットアップできます）すれば良いのでは？

それなら、カナダでもできます。

日本のsimを使えるようにするのも（多分）カナダでできると思います。電話番号とsmsを使えるようにするだけなら、単にsimをセットするだけでできるかもしれません（キャリアーによります）。

その状態で日本に持ってきて、日本で使う新しいAppleアカウントを作成すれば良いです。

こうすればカナダのAppleアカウントとは全く無関係に作れますので、どう転んでもカナダのAppleアカウントには影響しません。

複雑にし過ぎてるのでは。

日本用に端末とアップルアカウントを用意すればいいのでは。

Apple Accountでの購入に関連付けられているデバイスを確認・削除する - Apple サポート (日本)

これがどういう時に起きるのか不明なのですがApple Accountを切り替えた時に発生する可能性があります。