既出ですがもはやリンク先を読む人はほとんどいないと思うので一応引用しておきます。
ttps://discussions.apple.com/thread/8558478
A friend lent me a ssd thunderbolt drive, which I completely formatted.
With UtilityDisk have created a new APFS partition, and I used Carbon Copy Cloner to do a clone of the entire SSD USB3 to the new Thunderbolt SSD.
After the clone finished I've rebooted the mac, set the new drive as Startup Disk under the settings panel.
After the chime, now the apple logo appear after more or less 10 secs.
The boot time is now reduced from 2-3minutes to complessively about 20-30secs from the chime to OSX.
ttps://discussions.apple.com/thread/8556248
The problem occurs before the Apple logo shows up. It took up to 4 minutes before the logo shows. After that boot time was about 30-40 seconds. With the thunderbolt enclosure it is between 10 to 30 seconds until Apple logo and another 10 to 20 seconds boot time.
ちなみに私の環境だと USB 3 接続の外付け SSD Mojave APFS から再起動すると起動音が鳴ってから Startup Manager のウインドウが表示されるまで約 30 秒。Apple ロゴが表示されるまでさらに約 30 秒。普通の再起動でも起動音が鳴ってから Apple ロゴが表示されるまで 1 分弱。つまりほぼ同じ。そこからログインするまでさらに時間がかかる(多少ばらつきがある)。MacBook Pro 内蔵 SSD Mojave APFS のみだと起動音が鳴ってからすぐに Apple ロゴが表示されてログインするまでの合計は約 16 秒(先ほどの外付け SSD が接続されている場合はより遅くなる)。