Apple Musicの支払いについてです。
お支払い方法の順番を入れ替える
「編集」をタップし、順序の入れ替えアイコン を使って、お支払い方法の順番を入れ替えます。このリストの上から下の順番で、登録されているお支払い方法への請求が試みられます。Apple ID の残高への請求順序は変更できません。
と表記されているのですが、つまりはここに入金されているお金からApple Musicの支払いなどはされていくということでしょうか？
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そうですね。
Apple IDの残高（iTunesカードなどでチャージしたStoreクレジット残高）が最優先で、これは変更できません。
この残高で不足する場合は、その下のクレジットカードなどからの引き落としとなります。