WindowsのpcにiCloudフォトを同期した場合iCloud上にPCの写真が入ってきちゃうのか？

＞ちなみにiCloudはファミリーといった形で彼と共用していますがAppleIDは彼とは別です！

なら大丈夫です。お互いのデータが混在することはありません。

2TBの領域を二人で分けて使っているというだけで、各人のデータが一つになるわけではありませんから。

＞では写真の⬜︎iCloudフォトライブラリに✔︎を入れてもPCの写真はiCloudに勝手に入っていかないし、iCloudを通してPCの写真を見られることはない＞ということなのでしょうか？？

はい、そのとおりです。

逆に、もし共有したい写真があれば「iCloud写真共有」を有効にすれば「共有」フォルダにいれたものだけを二人で見ることができるようになります。

iCloudをインストールしたら、PC上にiCloud写真とiCloudドライブ

というフォルダができる

iCloudの写真を参照できるようになる

雲マークがついている写真は、サンプルなので

クリックすると実際のサイズの写真がダウンロードされてくる

ここまでは、基本機能です

で、、iCloudフォトライブラリですが

✔︎を入れたらPC側の写真がiCloudにアップロードされる

✔︎をオフならPC側の写真がiCloudにアップロードされない

PC内にあるすべての写真が勝手にiCloudにアップロードされるということはありません。

「iCloud写真」という専用のフォルダに放り込んだものだけがiCloudにアップロードされます。

ちなみに、iPhoneをお持ちでiCloud写真をオンにしてあれば、iPhoneの写真はすべて自動的にPCにダウンロードされます。

また、「彼氏と共有」というのは同じApple IDを使用しているということでしょうか？

もしそうなら、写真だけでなくすべてのデータがあなたのもの、彼氏のものという区別なく混在することになります。