App毎にパスワードを作る

何のパスワードの話をしているのでしょうか？もう少し具体的に書いたほうが良いです。

Apple IDでログインするタイプであれば、それはApple IDのパスワードであって、原則として共通です。

アプリによってはGoogleやMicrosoftアカウントでログインするものもありますが、その場合はGoogle/Microsoftのパスワードということです。

独自にパスワード設定するタイプのアプリなら、好きなものを設定できるはずです。

iCloudメールのパスワードはAppleIDのパスワードと同一なので、Appleの純正のメールアプリ以外を使う時に、AppleIDのパスワードが外部に漏れるのを防ぐためにそのアプリでだけで使えるiCloudメールアカウント用のパスワードを設定できる様になっています。

と言うか、Appパスワードを設定しないと純正以外のメールアプリでiCloudメールが使えない仕様です。