Logic Pro 11 - 急にトラック全体が音割れする

あなたのスクリーンショットの「マスタートラック」はデフォルトの「Stereo Out」のことですか。

わざわざ名称変更しておられるのですよね。

もしそうなら，それはそれで構いませんが（そうでなかったらかなりびっくり不可思議です），

1枚目のスクリーンショットではこのマスタートラックがモノラル（×2）構成になってます。

クリックしてステレオ構成に戻してください。

モノラル構成だとMasteringの表示が消えるとともにステレオ構成の時のプラグインは（互換性を保てないためだと思われるので）解除になります（載せていただいている2枚のスクリーンショットを見比べてください）。

なので，マスターにインサートしているコンプレッサー・リミッターなどが解除されているので，オーバーレベルになっているのではないでしょうか。

ミキサー表示（はご存知ですか？）もご覧になると様子がわかりやすいと思います。

まず原因究明ではないのですが，TimeMashineなどでバックアップをとっていなかったのですか。

TimeMachineでそのサンプルディレイをかける以前の日付のファイルを復元すればとりあえず済みそうですが，いかがでしょう。

何かのミスオペレーションならそれによって元に戻すことは造作もないことだと思いますが。

テキストだけではわかりにくいので，何か適切と思われるスクリーンショットを載せてください。

何かわかるかもしれません。