eSIMなのですがバッテリー修理に出す時の注意点は？

失礼致します。

下記リンクの「デバイスを Apple に配送する場合（配送修理）」＞「2.」の項目に、以下の様に記載されています。

● 必要に応じて、モバイル通信サービスを一時停止します。

• 物理的な SIM を使っている場合は、デバイスから取り外します。
• eSIM を使っている場合は、通信事業者にお問い合わせの上、新しい eSIM を入手するか、必要に応じてサービスの停止をお申し込み下さい。

iPhoneやiPadを修理に出す準備をする - Apple サポート (日本)

只、「必要に応じて」との事ですので、バッテリーサービスでも必要なのか、Apple サポート（受付時間 : 午前 9 時 ～ 午後 9 時）に問い合わせて確認 されて見ては如何でしょうか？

（下記リンクの「ライブサポートへのお問い合わせ」＞「日本」＞「国内からかける場合」の電話番号）

Appleサポートへのお問い合わせ - Apple サポート (日本)