削除したAppleアカウントに登録していたクレカを解約してしまった

支払いが完了できていないというのは、どのようにして確認しているのですか？

クレジットカードを解約した時点で未払いがあったとしても、カードを使ったときに決済は終わっていますから、そのクレジットカードに紐付いた銀行口座から引き落とされるはずだと思いますが。

それとも、Apple Accountを削除したときにサブスクリプションを解約しなかった（その請求が続いている）とか、そういう話でしょうか。

それなら、Appleサポートに相談して支払いを済ませてください。

解約されたカードをご自身が使うことはできませんから、削除したApple Accountで利用していたサブスクリプションを解約しなかったのではありませんか。

Appleサポートに相談してください。

削除というのは

Apple Account を削除する方法 - Apple サポート (日本)

これに従って、Appleにアカウントの削除を申請したということでしょうか？

これによると未払い残高があると削除はできないとなっています。

またサブスクリプションなどはサブスクの期間終了で解約されるとなっています。

従って削除後に課金されることはないはずです。

削除を申請したのではなく、デバイスからアカウントを消しただけなら

まだ有効なはずなのでサインインしてサブスクをキャンセルしましょう。