ないはずはありません。
OS X Yosemiteをクリーンインストールして前の環境を移行していない場合ない(もしくはフォルダはあっても中身はない)かもしれません。
com.apple.JapaneseAnalysis内にあった変換学習辞書に相当するファイルは OS X Yosemite では $HOME/Library/Dictionaries/JapaneseInputMethod/PhraseLearning_ja_JP.db.bundle で、これは「システム環境設定」>「キーボード」>「入力ソース」>「日本語」を選択し、右カラムを一番下までスクロールすると「変換学習:リセット」というのがありそちらを実行することで削除できます。
したがって、これまでcom.apple.JapaneseAnalysisの削除で対応していましたが、OS X Yosemiteでは今後まずこちらを試すことになると思います。
ただ、残った古いファイルが悪さをしているのか OS X Yosemiteでも日本語変換の不具合がcom.apple.JapaneseAnalysisの削除で対応できるケースもあるみたいなので「変換学習:リセット」で改善しない場合はcom.apple.JapaneseAnalysisの削除も試した方がいいかもしれません。
#それでも改善しなければ他の辞書ファイルが壊れているかもしれないので $HOME/Library/Dictionaries の削除も試す必要があると思います。
参考:「か」の変換の際の不具合
Yosemite 日本語入力 かな切替等
ただ、全く日本語変換ができないとなると他の原因も考えられます。まずはセーフモードと新規ユーザアカウントでの動作確認をしてみてください。
参考:トラブルシューティング for Mac (ソフトウェア編)