el capitan 再起動しない

結局USB接続の外部ハードディスクをはずしたところ正常に再起動、終了が出来るようになりました。

その外付けHDDのパーティションテーブルとフォーマットの形式は？

あと、HDDのアンマウントができずに終了操作が中断されている可能性がありますが、起動中にその外付けHDDをアンマウントはできますか？

ntfsを読み書きできるようにするユーティリティを入れてるのでは？

多分、そのユーティリティが10.11に対応してないのでは？

単にntfsの外付けhddを繋いでるだけなら（これだと、osxでは読むことしかできませんけど）、起動や終了がおかしくなることはありませんので。

PRAMクリア後でも同じ症状が続いてます。

SMCのリセットも試してください。

「トラブルシューティング for Mac (ハードウェア編)」

「トラブルシューティング for Mac (ソフトウェア編)」

あと、

再起動も終了も手動で電源を切り、再起動の場合は手動で起動してます。

ターミナルから

sudo shutdown -h now

でシャットダウン、

sudo reboot

で再起動できませんか？

追記：

ご参考：

「再起動ができない」

「OS 10.10.1で正常にシステム終了できません。」

「システム終了が出来ない」

等々。

フォーマットNTFSとなっていました。

NTFSだと、Macからは（デフォルトでは）読み込みしかできませんが、どうされてます？もしかして、NTFSを書き込み可能にするユーティリティをインストールされていませんか？

何かソフトを購入したとかではなくても、

I・O DATAのHDJ-Uシリーズで以前に購入したので対応Mac OSXは10.4〜10.9となっています。

この外付けHDDのユーティリティソフトとして添付されていたとか。

そういったユーティリティ類は、OSのバージョンアップで（対応していないと当然・あるいは・対応しなくなってしまって）トラブルの元になりますが…。Macで（のみ）お使いになるのなら、そういったユーティリティ類は入れずにGUIDパーティションテーブルでHFS+（Mac OS X拡張）でフォーマットすべきですし、Winとの共有が必要という話なら、exFAT等でフォーマットすべきでしょう…。

「Marvericksへのバージョンアップ後の不具合について」

「システム環境設定で BOOTCAMP が認識されない」

「10.9.2にアップデートをしたあたりから外付けhddをマウントしなくなった。」

等々、等々。

追記：

フォーマットの形式等は自分ではちょっとわからないのですが

Finderやディスクユーティティで確認できますが…。

a新しいMac ならクリーンインストールした方が早いかもです。

sそれだと事前にアンマウントするしか手がないかもしれません。以前、バッファロー製の外付けハードディスクで同じような症状になったことがありますが事前にアンマウントするしか手がなかったです。

Makoto0714 さんによる書き込み:

この外部ハードディスクは三つのパーティションに分けて使用していましたのでそれでフォーマットされていたのかもしれません。

それならその時にフォーマットしています。NTFS のままではOS X ではパーティション分けできないと思いますので。

RTFSの事など、これまでOSX Snow Lepardでは問題なく使えていたので気にもしていませんでしたし、よって読み書き出来るユーティリティーも入れていませんでした。

だったらNTFSには書き込みできないはずですが…。「問題なく使えていた」というのほどういう意味でしょうか？フォーマットがNTFSで書き込みができていたという話なら、書き込みできるようにするユーティリティを入れる等、Snow Leopardでそういう設定にしているはずです。

また、

タイムマシンのバックアップ先

にするなら、GUIDパーティションテーブルでHFS+でフォーマットされている必要があるはずです。

Makoto0714 さんによる書き込み:

問題の外部ディスクはタイムマシンのバックアップ先としていたので先ほどタイムマシンを開こうとしたらやはり「現在のTime Machine バックアップディスクに接続できません。」となっていました。ファイルの書き（保存）は出来たのですが。

それならHFS+ にフォーマットは変っていますね。