アプリで購入しようとしキャンセルになったが、残高が無くなって購入履歴もない

失礼致します。

iTunesカードを10000円分購入し、アカウントへチャージをしました。

チャージした時点では、Apple アカウントの残高に、チャージした 10,000 円分が反映されている事を確認 されているのですよね？

また、慢心さんが Apple アカウントに設定している「お支払い方法」は、Apple アカウントの残高だけ なのでしょうか？

その後アプリで課金をするために使用しようとした所、エラーが発生し購入がキャンセルされました。

肝心の エラーメッセージ は、どの様に表示されていますでしょうか？

（エラーメッセージは、不具合の原因や対処法を探る上で、大変重要な手掛かりですので、端折ったりせず一語一句正確にお願い致します）

もし、「サポートへご連絡ください。」と言うエラーメッセージが表示される場合は、Apple 側で対処する必要が有る（ユーザ側では対処出来ない）と言う事ですので、Apple サポートに連絡（受付時間 : 午前 9 時 ～ 午後 9 時）して事情を説明 して下さい。

サポートや修理サービスに関する Apple へのお問い合わせ - Apple サポート (日本)

その後アカウントを確認した所、購入履歴はないのに先程チャージした分が無くなっており、当然アプリにも反映されていない状態

下記リンクの「Apple アカウントの残高が正しく表示されない場合」の項目に、以下の様に記載されていますので、確認して見て下さい。

• Apple アカウントの残高が正しくないと思う場合は、App Store または iTunes Store から一旦サインアウトし、サインインし直してから残高を再び確認 して下さい。 

Apple アカウントの残高を確認する - Apple サポート (日本)

また、未払いやサブスクリプションの支払い等が有って、App 内課金で購入しようとしたタイミングで、Apple アカウントの残高から支払いが行われた可能性 は有りませんでしょうか？

（その場合は、後程 Apple から「領収書」メールが届くかと思います）