現在、どういう状況でしょうか?
sierraをダウンロードって、sierraのインストールアプリをダウンロードしたんじゃないですか?
それだと再起動にはならないと思うのですが。
再起動もできないようなら、el capitanのクリーンな状態に戻すしかないのでは?
el capitanのusbインストーラは作ってますか?
usbインストーラが作ってあれば、1時間程度で(インストール可能な)色々なバージョンのmacOSを自由にインストールできます。
catalina以下のmacOSバージョンなら、8GBのusbでusbインストーラを作成できます。
macOSのインストールアプリは以下のサイトにsafariでアクセスすれば、app storeなどからダウンロードできます(macOSバージョンによってはシステム環境設定のソフトウェアアップデートからのダウンロードになります)。
macOS をダウンロードしてインストールする方法 - Apple サポート (日本)
インストーラアプリをダウンロードできれば、sierra以下だと、インストトールとすると、インストーラアプリがアプリケーションフォルダーにインストールされます。high sierra以上では、ダウンロード完了と同時にインストーラアプリがアプリケーションフォルダーにインストールされます。いずれにしろ、アプリケーションフォルダーにインストーラアプリがある状態で前に紹介したサポート記事(インストーラアプリのダウンロードのサポート記事内にもリンクが書いてあります)に従えばusbインストーラを作成できます。
なんかmacの調子が良くなさそうですし、el capitan以上のusbインストーラを作成しておく方が能率は格段に上がります。内蔵ディスクで起動しなくなったら、usbインストーラで起動すれば良いですから。